Для продвижения наукоемкой продукции на рынке и ее сервисного обслуживания совместно с партнерами создана инфраструктура инновационной деятельности, включающая проблемные и научно-исследовательские лаборатории, научно-инженерные и внедренческие центры, бизнес-инкубатор, инновационный центр и др.

Кафедры, лаборатории являются составной частью Учебно-научно-производственного объединения «Дальневосточный государственный университет путей сообщения - Дальневосточная железная дорога» (УНПО «ДВГУПС - ДвостЖД»).

В университете созданы и успешно работают:

• Центр энергоаудита промышленных предприятий, который объединяет усилия кафедр энергетической и теплотехнической направленности и водоснабжения;
• Центр по сертификации рабочих мест по охране труда. Основными задачами центра сертификации являются проведение измерений при аттестации рабочих мест, сертификация работ по охране труда в организациях, оформление и выдача сертификатов соответствия работ по охране труда, инспекционный контроль над сертификационными работами по охране труда в организациях;
• Центр гуманитарных и социально-экономических исследований. Основными направлениями деятельности Центра являются: проведение научно-исследовательской работы в гуманитарной и социально-экономической сфере; создание университетского информационного банка данных гуманитарных и социально-экономических научных исследований; организация и проведение научных и научно-практических конференций по гуманитарным и социально-экономическим наукам. В мае 2005 и 2006 годах Центром организованы и проведены Международные симпозиумы "Культурно-экономическое сотрудничество стран северо-восточной Азии";
• Центр «Технолог». Центром получены лицензии по следующим видам работ: аттестация сварщиков и специалистов сварочного производства, механические испытания, химический анализ, неразрушающий контроль. За прошедший год созданы лаборатории: механизированной сварки металлов, сварки полимеров, механических испытаний, химического анализа, неразрушающего контроля. В Центре прошли аттестацию свыше 670 работников региона.

Учитывая насущную необходимость коммерциализации результатов научной деятельности, в университете создан «Инновационный центр». Основной задачей центра является реклама и реализация законченных инновационных разработок среди промышленных отечественных и зарубежных предприятий и фирм. Первыми результатами работы этого центра были презентации и заключение договоров с МУП «Стрела», Хабаровским «Водоканалом», Союзом предпринимателей г. Хабаровска и южнокорейской корпорацией "Halla Соnkrete" .